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加班计入工资薪酬总额，不计入福利费。加班需要计算个税。
出差补贴应该计入差旅费，出差补贴不需要计算个税的。
依据：
关于印发《征收个人所得税若干问题的规定》的通知
国税发〔1994〕089号
二、关于工资、薪金所得的征税问题
（二）下列不属于工资、薪金性质的补贴、津贴或者不属于纳税人本人工资、薪金所得项目的收入，不征税：
1．独生子女补贴；
2．执行公务员工资制度未纳入基本工资总额的补贴、津贴差额和家属成员的副食品补贴；
3．托儿补助费；
4．差旅费津贴、误餐补助。
可以的，属于旅客交通运输服务的增值税电子普通发票，属于可以抵扣的凭证。
不是的，只有残疾人工资作为加计扣除的基数的。
文件依据：《关于安置残疾人员就业有关企业所得税优惠政策问题的通知》(财税[2009]70号)第一条规定：企业安置残疾人员的，在按照支付给残疾职工工资据实扣除的基础上，可以在计算应纳税所得额时按照支付给残疾职工工资的100%加计扣除。
根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第八十七条规定，企业所得税法第二十七条第(二)项所称国家重点扶持的公共基础设施项目，是指《公共基础设施项目企业所得税优惠目录》规定的港口码头、机场、铁路、公路、城市公共交通、电力、水利等项目。
企业从事前款规定的国家重点扶持的公共基础设施项目的投资经营的所得，自项目取得第一笔生产经营收入所属纳税年度起，第一年至第三年免征企业所得税，第四年至第六年减半征收企业所得税。
是的。
根据《企业会计准则第4号——固定资产》第八条 外购固定资产的成本，包括购买价款、相关税费、使固定资产达到预定可使用状态前所发生的可归属于该项资产的运输费、装卸费、安装费和专业人员服务费等。
如果执行小企业准则直接计入本期所得税费用科目及营业外支出科目，如果执行企业会计准则，通过以前年度损益调整可科目核算。
滞纳金支付应填入现金流量表项目中的:"支付的其他与经营活动有关的现金支出"栏目;
关于药品简易征收主要政策包括：
自2012年7月1日起，属于增值税一般纳税人的药品经营企业销售生物制品，可以选择简易办法按照生物制品销售额和3%的征收率计算缴纳增值税。
自2016年4月1日起，属于增值税一般纳税人的兽用药品经营企业销售兽用生物制品，可以选择简易办法按照兽用生物制品销售额和3%的征收率计算缴纳增值税。
自2018年5月1日起，增值税一般纳税人生产销售和批发、零售抗癌药品，可选择按照简易办法依照3%征收率计算缴纳增值税。上述纳税人选择简易办法计算缴纳增值税后，36个月内不得变更。
对进口抗癌药品，减按3%征收进口环节增值税。
自2019年3月1日起，增值税一般纳税人生产销售和批发、零售罕见病药品（比如波生坦、青霉胺等），可选择按照简易办法依照3%征收率计算缴纳增值税。上述纳税人对进口罕见病药品，减按3%征收进口环节增值税。
程序上：选择简易办法计算缴纳增值税后，36个月内不得变更。纳税人应单独核算简易计税销售额；未单独核算的，不得适用简易征收政策。
“财税〔2016〕36号”文件附件2《营业税改征增值税试点有关事项的规定》对这个政策描述如下：
在资产重组过程中，通过合并、分立、出售、置换等方式，将全部或者部分实物资产以及与其相关联的债权、负债和劳动力一并转让给其他单位和个人，其中涉及的不动产、土地使用权转让行为，属于不征收增值税项目。
如果符合上面描述情形，自可作为不征税项目。
需要了解具体对方提供了什么服务，如果按开票信息理解，对方是国际货物运输代理，属于中介服务，不是提供运输服务，所以会计核算上要按照实际情况计入代理费用支出，不应该计入运输费。
按照您的描述，“公司有偿收回”，而且又是“2010年”的房屋，显然，无论当时是否办理了房产证（税务处理并不只是看办不办房产证），这个销售已经实现。
既然如此：
一、2010年销售，“当时开具发票且缴纳了营业税及其附加”，那这个业务就完成了。
二、所谓“有偿收回”，其实就是您公司又买回来，这个环节，您可能要求买方（就是所述“客户”）给您开具专用发票，您公司用于增值税、所得税等抵扣和扣除。
三、您公司销售这个房子，这是又一个销售业务，自然涉及增值税、附加税费、印花税、土地增值税、企业所得税等。但如上所述，您公司可以凭客户给您开具的发票予以抵扣、扣除。
您是说收到专票，但是用于免税项目是吗？目前在收到纸质发票情况下，还是要求收到发票后做勾选认证或者认证不抵扣的系统操作，目的还是要核对一下纸质发票和系统信息，所以建议最好取得纸票后再操作。
这要看体检的性质，如果和工作相关，比如入职体检或者特殊岗位工作需要的体检就不需要缴纳个税。但如果是福利性质，且能具体明确为每个人承担的体检费用，就需要计算个税的。
