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能说一下具体业务吗？是购买债券然后转让？
购入基金、信托、理财产品等各类资产管理产品持有至到期，不属于“金融商品转让”，取得的若是非保本的收益，不缴纳增值税。
如果是保本收益需要按贷款服务缴纳增值税。
参考文件：《财政部、国家税务总局关于明确金融、房地产开发、教育辅助服务等增值税政策的通知》（财税【2016】140号）第二条。
如果是转让需要缴纳增值税。
金融商品转让是指转让外汇、有价证券或非货物期货的所有权的行为，包括股票转让、债券转让、外汇转让、其他金融商品转让。
金融商品转让属于金融服务，一般纳税人适用税率为6%，小规模纳税人征收率为3%。
金融商品转让，按照卖出价扣除买入价后的余额为销售额。出现的正负差，按盈亏相抵后的余额为销售额。若相抵后出现负差，可结转下一纳税期与下期转让金融商品销售额相抵，但年末时仍出现负差的，不得转入下一个会计年度。
按目前规定，并没有要求款项必须由购买方支付，如果有特殊原因，一定需要母公司代为支付款项，留存必要证据资料证明业务真实性就可以。
需要签订一个三方协议或者委托付款协议，来作为母公司付款的支撑。
不过话说回来，为啥母公司非要替子公司付款呢？不能找把款项给子公司，子公司再付款吗？
一、按照《财政部 国家税务总局关于国有土地使用权出让等有关契税问题的通知》（财税〔2004〕134号）相关文件规定，应当缴纳契税。
二、关于追征期，若非偷税，则上述税额为三年；若为偷税，则无限期追征。按照税收征管法第六十三条规定，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁账簿、记账凭证，或者在账簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税。
三、关于滞纳金是否可以超过税款本金，建议直接与主管税务机关沟通一下。
是销售俩种不同商品？一种自产，一种外购？那就分别按俩种商品税率计算各自增值税。
铂略用户60618071