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股东是自然人还是企业法人？自然人股东转让股权如果大于原投资成本按20%计算个税，企业法人取得转让收益并入应纳税所得额计算企业所得税，另外股权转让还涉及印花税。
自然人退股和股权转让计算个税是一样的
法人股东从被投资企业撤资，新股东投资入股被投资企业。投资企业从被投资企业撤回或减少的投资，相当于初始出资的部分，应确认为投资收回；相当于被投资企业累计未分配利润和累计盈余公积按减少实收资本比例计算的部分，应确认为股息所得；其余部分确认为投资资产转让所得，以此减少企业的股权转让所得。—（税务总局公告2011年第34号）
法人股东如果被投资企业存在未分配利润和盈余公积的情况下，撤资退股比股权转让节税。
印花税是针对新老股东转让环节缴纳的，只要发生股权转让就需要双方各自缴纳。
目前增值税法细则还没有出来，这个还不能确定呢，建议关注后续增值税法细则。
目前大家分析可以抵扣，是依据增值税法
第二十二条纳税人的下列进项税额不得从其销项税额中抵扣: (五)购进并直接用于消费的餐饮服务、居民日常服务和娱乐服务对应的进项税额
这条对应现行规定是购进的贷款服务，餐饮服务，居民日常服务和娱乐服务进项税额不可以抵扣，新旧对比，看到贷款服务不在列示范围了，所以分析是否增值税法后贷款服务就可抵扣了，但细则出台前，没有办法确定的。
1.2问您说的正确
3.长投是按什么方式核算，如果按权益法核算，进行了长投价值调整的话，需要填写105030报表。
专利申请费可以加计扣除，专利代理费不可以，而且即便可以加计扣除，也是要回到研发当年追补加计扣除。
Ruber