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一般情况下的规定：
应税凭证及税率 ：根据《中华人民共和国印花税法》，无偿划转资产或股权时，若签订了产权转移书据，属于印花税的征税对象，税率为转让价款的万分之五。
计税依据确定 ：如果应税产权转移书据未列明金额，印花税计税依据按照实际结算的金额确定；若无实际结算，则按照书立合同、产权转移书据时的市场价格确定。但实际操作中，对于无偿划转协议中未列明转让金额的情形，应与当地税务机关沟通确认计税依据及征收方式。
特殊情况下的免税政策
同一投资主体内部划转 ：根据《关于企业改制重组及事业单位改制有关印花税政策的公告》（财政部 税务总局公告 2024 年第 14 号）第三条规定，对同一投资主体内部划转土地使用权、房屋等建筑物和构筑物所有权、股权书立的产权转移书据，免征印花税。
我的理解国有企业也是政府投资主体，省政府无偿划转资产应该可以免印花税，但建议与当地税务部门进一步沟通为妥。
《关于贯彻实施契税法若干事项执行口径的公告》(财政部 税务总局公告2021年第23号，以下简称“23号公告”)规定，土地使用权出让的，计税依据包括土地出让金、土地补偿费、安置补助费、地上附着物和青苗补偿费、征收补偿费、城市基础设施配套费、实物配建房屋等应交付的货币以及实物、其他经济利益对应的价款。依据该条款，城市基础设施配套费须缴纳契税。
可以登录电子税务局 -财产和行为税税源采集及合并申报模块进行采集和申报。
账务处理与税务处理（开票），并无必须要求一致的说法。既然分公司开票，只要能够准确计算纳税，那（是否独立核算）其实也没啥大的影响。
发票开具的基本原则，乃是与事实完全相符。
如您所述，税率一样，金额合计也是一样，且商品名一样。因此大致而言，应当问题不大。当然，这样“单价固定”，于这一栏次，或者有点瑕疵；谨慎起见，您可直接与主管税务机关沟通一下。
语阳少爷