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【解答】您好！
这个应当按照独立市场原则计价，按照销售土地、房产缴纳增值税、附加税费、印花税（双方缴纳）、土地增值税、企业所得税、契税（买方缴纳）。
根据税收征管法及其实施细则的相关规定，企业或者外国企业在中国境内设立的从事生产、经营的机构、场所与其关联企业之间的业务往来，应当按照独立企业之间的业务往来收取或者支付价款、费用；不按照独立企业之间的业务往来收取或者支付价款、费用，而减少其应纳税的收入或者所得额的，税务机关有权按照下列方法调整计税收入额或者所得额:
(一)按照独立企业之间进行的相同或者类似业务活动的价格；
(二)按照再销售给无关联关系的第三者的价格所应取得的收入和利润水平；
(三)按照成本加合理的费用和利润；
(四)按照其他合理的方法。
如果签订一份合同，则为一项应税交易，应当从主（13%）计税。
如果签订两份合同，则需要进行区分：如果开发的“软件”与销售的“软件”，并非同一软件，举个容易理解的例子，您买给张三一辆奥迪，然后给张三另一辆大奔保养，这是两项交易，则可分别计税。反之，二者乃是统一，即给卖的“软件”提供开发服务，那还是属于一项交易，应当从主（13%）计税。
个人理解，仅供参考；您也可与主管税务机关沟通、确认一下。
一次扣除没有问题。因为这个政策适用于房屋建筑物之外固定资产且单价不超过500万元，您的情形是符合的。
但是，因为6月购买，则次月开始计提折旧，因此应当扣除于第三季度，而非第二季度。
财务和税务的角度基本原则都是真实性，只要您业务真实，收入和成本真实，利润率是多少都是没有问题的，并没有用利润率来衡量企业安全与否的标准。
铂略会员70563145