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根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第一条、第四条相关规定，在中华人民共和国境内销售货物或者加工、修理修配劳务（以下简称劳务），销售服务、无形资产、不动产以及进口货物的单位和个人，为增值税的纳税人，应当依照本条例缴纳增值税。纳税人销售货物、劳务、服务、无形资产、不动产，统称应税销售行为。
一般来讲，应付账款不必支付或者无法支付而结转营业外收入，或者因“债转股”而结转实收资本、资本公积，本身并不涉及上述增值税“应税销售行为”，因而不产生增值税缴纳义务。当然，若事实上涉及“应税销售行为”，理应依法缴纳。
按目前规定，并没有要求款项必须由购买方支付，如果有特殊原因，一定需要母公司代为支付款项，留存必要证据资料证明业务真实性就可以。
需要签订一个三方协议或者委托付款协议，来作为母公司付款的支撑。
不过话说回来，为啥母公司非要替子公司付款呢？不能找把款项给子公司，子公司再付款吗？
一、按照《财政部 国家税务总局关于国有土地使用权出让等有关契税问题的通知》（财税〔2004〕134号）相关文件规定，应当缴纳契税。
二、关于追征期，若非偷税，则上述税额为三年；若为偷税，则无限期追征。按照税收征管法第六十三条规定，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁账簿、记账凭证，或者在账簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税。
三、关于滞纳金是否可以超过税款本金，建议直接与主管税务机关沟通一下。
是销售俩种不同商品？一种自产，一种外购？那就分别按俩种商品税率计算各自增值税。
铂略会员60601045