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【解答】您好！您的问题分两个方面答复如下：
第一：合伙企业股权转如何交税？
《国家税务总局关于切实加强高收入者个人所得税征管的通知》（国税发〔2011〕50号）规定：对个人独资企业和合伙企业从事股权（票）、期货、基金、债券、外汇、贵重金属、资源开采权及其他投资品交易取得的所得，应全部纳入生产经营所得，依法征收个人所得税。
《财政部国家税务总局关于印发<关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定>的通知》（财税〔2000〕91号）规定：第四条 个人独资企业和合伙企业（以下简称企业）每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，作为投资者个人的生产经营所得，比照个人所得税法的个体工商户的生产经营所得应税项目，适用5%～35%的五级超额累进税率，计算征收个人所得税。
按照上述文件的规定可以判定，合伙企业的股权转让所得属于合伙企业的生产经营所得，依据合伙企业生产经营所得采取先分后税的原则，对于个人投资人，比照个人所得税法的个体工商户的生产经营所得应税项目，适用5%～35%的五级超额累进税率，计算征收个人所得税；对于法人企业投资者，应当按适用税率缴纳企业所得税。
第二、从二级市场购入股票卖出如何交税，涉及哪些税种，税率及依据是？
《财政部国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号）规定：“金融商品转让，按照卖出价扣除买入价后的余额为销售额。
转让金融商品出现的正负差，按盈亏相抵后的余额为销售额。若相抵后出现负差，可结转下一纳税期与下期转让金融商品销售额相抵，但年末时仍出现负差的，不得转入下一个会计年度。
金融商品的买入价，可以选择按照加权平均法或者移动加权平均法进行核算，选择后36个月内不得变更。”
从二级市场购入股票，应按金融服务—金融商品转让缴纳增值税。以卖出价扣除买入价后的余额为销售额。适用税率为6%，小规模纳税人适用3%征收率。
仅供参考，具体请咨询当地税务机关。
按目前规定，并没有要求款项必须由购买方支付，如果有特殊原因，一定需要母公司代为支付款项，留存必要证据资料证明业务真实性就可以。
需要签订一个三方协议或者委托付款协议，来作为母公司付款的支撑。
不过话说回来，为啥母公司非要替子公司付款呢？不能找把款项给子公司，子公司再付款吗？
一、按照《财政部 国家税务总局关于国有土地使用权出让等有关契税问题的通知》（财税〔2004〕134号）相关文件规定，应当缴纳契税。
二、关于追征期，若非偷税，则上述税额为三年；若为偷税，则无限期追征。按照税收征管法第六十三条规定，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁账簿、记账凭证，或者在账簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税。
三、关于滞纳金是否可以超过税款本金，建议直接与主管税务机关沟通一下。
是销售俩种不同商品？一种自产，一种外购？那就分别按俩种商品税率计算各自增值税。
铂略会员97166147