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一、增值税方面
《财政部税务总局关于明确养老机构免征增值税等政策的通知》（财税〔2019〕20号）规定，自2019年2月1日至2020年12月31日（延续至2027年12月31日），对企业集团内单位（含企业集团）之间的资金无偿借贷行为，免征增值税。
但是，若非“企业集团”，则需要视同销售，缴纳增值税。
二、企业所得税
《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例“第六章 特别纳税调整”明确规定了关联企业间应当按照独立原则进行税务处理。也就是说，关联企业间无偿提供资金借贷，应当依法进行纳税调整、确认（视同取得）利息收入，缴纳企业所得税。
三、《印花税税目税率表》明确规定，借款合同印花税的征税范围是指“银行及其他金融组织和借款人（不包括银行同业拆借）所签订的借款合同”。一般情况下，对于非金融企业间资金拆借，无论是否具有关联关系，无论是否约定利息，皆非印花税征收范围。
这个属于特殊情况，也就是对方这张发票抵扣其实也错误了，但由于已经注销，无法再去调整了，我建议您这边按无票收入冲减原9%税率的收入，然后按13%开具普票，重新按13%申报。我觉得这个肯定不是完全合规的操作，但因为对方已经注销，无法红冲原发票，这样做是一个变通做法，或者您详细咨询一下本地主管税务看看有没有更合规的办法。
按25+10结果判断，季度销售额超过30万，对于其他不免税的10万需要申报纳税。
25万填写到第九行“免税销售额”和十二行“其他免税销售额”，并填写“减免税申报明细表”
10万填写到第一行“应征增值税不含税销售额”，并根据是专票还是普票填写第二行或者第三行
主要还是要看税务机关对于事件性质的认定，是否有主观故意的不缴或少缴税款的行为，如存在主管故意，则有可能并定义为偷税并无限期追征
Vito Broad