税药不分离——医药制造业增值税全景解码与合规重塑

课程介绍：

2026年增值税法及配套公告的落地，对医药制造业的影响远不止税率调整这么简单。

生物制品3%简易征收时代的终结、平销返利的合规重构、研发环节税惠政策的叠加适用、两票制背景下的发票合规压力——这些变化正在倒逼医药企业重新审视从研发、生产到流通的全链条税务管理。

医药制造业具有研发投入大、产品生命周期长、销售模式复杂、税收优惠密集的特点，财务人员若仅停留在“按票抵税”的惯性思维，极易给企业埋下重大风险。

本课程立足医药制造业特有业务场景，从计税转型、销售解码、研发税惠、资产策略、风控防线五个维度，提供可落地的核算重构方案与深度风控策略。

本课程重点介绍了医药制造业增值税的实操处理以及合规应对等。

讲师介绍：

胡 老 师

20年企业财务经验、财税管理实战专家

三好医药有限公司前财务总监

山东赫尔税务师事务所有限公司前总经理

胡老师深耕于财税领域20年，先后在企业担任财务经理、财务总监等职位；在企业财务管理分析、税收筹划与风险管控、税务稽查等方面积累了丰富的实战经验。为各类型的公司制定合理财税筹划、风险管控以及合理节税服务，助力企业解决各类财税问题，提高企业财税相关人员的管理和防控理念。累计服务客户高达30多家，涉及节税金额8000余万元。胡老师是注册税务师（CPT）、高级国际财务管理师（IFM）。

模块介绍：

模块一：计税之变——生物制品简易征收时代落幕

本章节主要介绍了医药制造行业特点和增值税核心特点、以及新规下医药制造行业3%简易政策取消等增值税核心变化。

模块二：流通解码——医药返利的税务“拆弹指南”

本章节主要介绍了平销返利、实物返利、两票制的规定以及风险。

模块三：研发税享——医药创新的“减负组合拳”

本章节主要介绍了技术转让优惠、加计递减、研发费用加计扣除等优惠政策和风险注意点。

模块一：计税之变——生物制品简易征收时代落幕

一、 医药制造行业核心特点

• 需求刚需抗周期：老龄化 + 医疗刚需，经济波动影响小，医保支撑需求。

• 三高行业：高研发投入、长研发周期、高研发风险；（研发不一定成功）

• 壁垒分明：创新靠专利，仿制药拼成本与中标，原料药受环保与周期影响。

二、 医药制造行业增值税核心特点

• 基准税率 13%：化药、普通生物药、中成药统一货物税率 13%；研发、技术转让 6%；

• 进项抵扣先天偏弱：生物药成本多为研发、人工、血浆采购，无专票、进项少，实际税负偏高；中药材自采按 9% 计算抵扣进项。

• 多税率分账核算：企业同时生产普药、特药、免税药，需分开核算，未分开从高计税。

三、 新规下医药制造行业增值税核心变化

• 普通生物制品取消 3% 简易计税（行业最大变动）

1. 旧规：疫苗、血制品、普通生物药可自选3% 简易、不抵扣进项；

2. 新规（2026.1.1 起）：全部改为 13% 一般计税，强制进项抵扣，原财税〔2009〕9 号生物简易政策废止；

3. 例外保留：抗癌药、罕见病药全链条仍可选 3% 简易（2026-2027 年底有效），选定后 36 个月不得变更；国产抗艾滋病药生产+流通全环节继续免征增值税。（财政部 税务总局公告2023年第62号）

• 自产创新药无偿赠药免税政策明确落地（新增优惠）

1. 2026—2027年：药企自产创新药免费赠送给临床试验 / 患者的同品种药品，免征增值税，要求分开核算、单独台账，混用无法划分进项需转出。（财税〔2015〕4 号）

2. 创新药，是指经国家食品药品监督管理部门批准注册、获批前未曾在中国境内外上市销售，通过合成或者半合成方法制得的原料药及其制剂。

• 中药材进项抵扣规则法定化（中成药企业利好）

1. 初级中药材属于农产品，收购发票 / 自产农户普票按买价 ×9% 计算抵扣进项；

2. 从小规模药材商取得 3% 专票，按票面金额 ×9% 抵扣，不按票面 3% 税额抵扣；（如果取得的是1%专票，不能按票面金额乘以9%抵扣）

3. 深加工成中成药（13% 税率货物），领用中药材可按1% 加计抵扣维持原抵扣力度；

• 简易计税从严管控，同品类不得拆分计税

1. 药企同时生产多款抗癌 / 罕见药：同大类药品要么全简易 3%、要么全一般 13%，不能部分简易部分一般；

2. 除抗癌、罕见、抗艾三类，其余化药、中成药、普通生物药无简易可选，彻底清理零散简易优惠。

四、 生物制品增值税的“历史性转折”3%简易征收政策的终结

• 旧政策原文：财税〔2009〕9 号原文（初始 6% 简易）已废止

中华人民共和国财政部第二条第（三）项第 4 目：一般纳税人销售自产的

用微生物、微生物代谢产物、动物毒素、人或动物的血液或组织制成的生物制

品，可选择按照简易办法依照 6% 征收率计算缴纳增值税；选择简易计税，进

项税额不得抵扣，选定后 36 个月不得变更；

• 财税〔2014〕57 号原文（6%→3%，现行执行至 2025.12.31）

第二条：财税〔2009〕9 号第二条第（三）项 “依照 6% 征收率” 调整

为 “依照 3% 征收率”，2014 年 7 月 1 日起执行。

规则：自产普通生物药（疫苗、血制品、单抗、生化制剂）一般纳税人自

主二选一：①3% 简易（进项不能抵）；②13% 一般计税（进项可抵）

• 新政策

《财政部 税务总局关于增值税法施行后增值税优惠政策衔接事项的公告》（财政部 税务总局公告 2026 年第 10 号）第六条规定，除本公告和增值税法、增值税法实施条例、《财政部 税务总局关于个人销售住房增值税政策的公告》（财政部 税务总局公告 2025 年第 17 号）外，在2025年12月31日前制发文件规定的国内环节增值税优惠政策同时停止执行。10号公告第三条“适用简易计税方法的项目”未列明一般纳税人销售生物制品可选择适用简易计税方法。因此，自2026年1月1日起，一般纳税人不论是生产销售，还是批发、零售生物制品，均应按照一般计税方法计算缴纳增值税。但若相关生物制品属于抗癌药品、罕见病药品，且符合相关政策规定，可按照简易计税方法计算缴纳增值税：