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所谓“全电”或者“数电”发票，只是一种开票形式，还要区分专用发票还是普通发票。如果属于“全电”或者“电子”专用发票，自然可以依法抵扣。如果属于“电子”普通发票，则目前只有公路通行费和国内旅客运输服务才可依法抵扣。
根据“财政部 税务总局公告2023年第5号”一、自2023年1月1日起至2027年12月31日止，对物流企业自有（包括自用和出租）或承租的大宗商品仓储设施用地，减按所属土地等级适用税额标准的50%计征城镇土地使用税。
如上所述，若为建设期间，尚未开展仓储业务，则是否作为“仓储设施用地”，确实存在歧义，文件似乎也未明确；建议最好直接与主管税务机关沟通一下为妥。
按照上面描述，乃是“服务（设计）+货物（物料）”的混合销售。若销售方以服务为主营，则一并按照服务（6%）开具发票是对的。
相关政策：“财税〔2016〕36号”文件附件1《营业税改征增值税试点实施办法》
第四十条 一项销售行为如果既涉及服务又涉及货物，为混合销售。从事货物的生产、批发或者零售的单位和个体工商户的混合销售行为，按照销售货物缴纳增值税；其他单位和个体工商户的混合销售行为，按照销售服务缴纳增值税。
本条所称从事货物的生产、批发或者零售的单位和个体工商户，包括以从事货物的生产、批发或者零售为主，并兼营销售服务的单位和个体工商户在内。
其实，作为一个医药企业，咨询了什么呢？（上面也说了，“高额”咨询服务费）但凡了解医药企业的人，恐怕都会怀疑的。或者说，但凡了解医药企业的人，都会第一时间猜到某个原因的。确实，这个不可能有具体列举，就是一个目的导向，怎么能够证明：到底咨询了什么？到底真的咨询了吗，而不是别的什么原因？当然，如果真的咨询了，支付费用与咨询服务合理匹配，那是没有问题的。
加弥