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不可以。
列于研发费用，必须与研发活动相关。《国家税务总局关于研发费用税前加计扣除归集范围有关问题的公告》（国家税务总局公告2017年第40号）也明确这一点：
六、其他相关费用
指与研发活动直接相关的其他费用，如技术图书资料费、资料翻译费、专家咨询费、高新科技研发保险费，研发成果的检索、分析、评议、论证、鉴定、评审、评估、验收费用，知识产权的申请费、注册费、代理费，差旅费、会议费，职工福利费、补充养老保险费、补充医疗保险费。
两种方式其实都可以：
一是商贸公司给个体户开票，您再给商贸公司开票；这样商贸公司就是一收一支，不能按照“代收代付”处理了。
二是您直接给个体户开票，这样商贸公司可以按照“代收代付”处理。当然，这个情况修订一下合同，明确这个事情也好。
发票开具，应当据实；而不应根据客户要求开具。如果发货是泵，就必须开泵，不能开轴承；反之亦然。否则涉嫌票实不符；严格来讲，也算是虚开发票了。
机器维修和机器销售税率都是13%，所以开具货物类或者维修服务类不影响纳税，但还是应该根据实际业务开具，如您所述如果维修为主包含了设备款，统一按维修服务开具更合适，但如果设备金额较大，属于与维修可以分开单独计价的，分别开具货物和维修服务发票也可以。
如果统一开货物发票，建议合同与之对应，描述应体现为更换设备同时负责维修。
Kitty Benedict